機械地精小野，得到了先知的預言，踏上尋找傳說之中的天災領袖之旅，抵抗即將到來的末世而高校內，麻瓜少年林默，遭受著校園惡霸的淩辱與調戲，放不下面子的他，拒絕了救出自己的天才劍道美少女羅小丸的幫助，孤單的林默在夢鄉之中，看到了神秘元素生物，驚醒他手掌中之中出現了黑色的印記，從此他的人生變得不再普通。遭遇神秘組織近衛刺客襲擊的林默，被裝成轉學生的小野救下後，爲了變強，守護自己喜歡的女孩，展開了刻苦的修行。正當林默終于與羅小丸在一起之時，空降的冷豔美女，孟雪兒，帶著更大的陰謀來襲，面對受重傷的小野與生死不知的羅小丸，林默不再選擇逃避，天災的領袖浴火重生，世界將再一次顫栗。