熊貓星球正值百年慶典之際，全體熊貓們沉浸在歡樂的海洋之中，就在此時，邪惡的鼠司令向熊貓星球發起了進攻，將所有的熊貓都變成了小醜。太空熊貓（易小寅 飾）和它的好友們僥幸逃過一劫，一行人來到了位于熊貓星球地下的秘密基地之中。爲了拯救熊貓一族，太空熊貓需要找到失傳多年的秘密神器，與此同時，鼠司令亦在尋找神器，它想要利用神器的力量獲得統一宇宙的無上權力。兩方人馬展開了對于神器的你爭我奪，鼠司令生來陰險狡詐，正直勇敢的宇宙熊貓該怎樣面對它所使出的重重詭計呢？時間在一分一秒的流逝著，太空熊貓的複國大業最終能否順利完成？